Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LmnaP48678 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LmnaP48678 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LmnaP48678 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms