Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LtbP41155 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtbP41155 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtbP41155 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtbP41155 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LtbP41155 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms