Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VhlP40338 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
VhlP40338 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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