Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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