Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgaP26339 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms