Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NdnP25233 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
NdnP25233 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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NdnP25233 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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NdnP25233 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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NdnP25233 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NdnP25233 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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