Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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SftpcP21841 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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SftpcP21841 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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SftpcP21841 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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SftpcP21841 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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SftpcP21841 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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SftpcP21841 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms