Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P20040 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P20040 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms