Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06323 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06323 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P06323 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06323 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06323 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P06323 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P06323 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P06323 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P06323 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06323 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06323 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms