Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ifnb1P01575 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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