Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cfdp1O88271 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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