Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kcns1O35173 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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