Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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