Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm21818J3KMS6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm21818J3KMS6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm21818J3KMS6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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