Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms