Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms