Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms