Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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