Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms