Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms