Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp8nlA2ABX0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms