Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

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Length 1,946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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