Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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