Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Plod1Q9R0E2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Plod1Q9R0E2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms