Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

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Length 1,129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Atp11cQ9QZW0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Atp11cQ9QZW0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp11cQ9QZW0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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