Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chaf1aQ9QWF0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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