Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Csnk1eQ9JMK2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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