Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rnf6Q9DBU5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rnf6Q9DBU5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rnf6Q9DBU5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rnf6Q9DBU5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rnf6Q9DBU5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rnf6Q9DBU5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rnf6Q9DBU5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rnf6Q9DBU5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf6Q9DBU5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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