Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Phf6Q9D4J7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Phf6Q9D4J7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Phf6Q9D4J7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Phf6Q9D4J7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Phf6Q9D4J7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Phf6Q9D4J7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Phf6Q9D4J7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Phf6Q9D4J7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Phf6Q9D4J7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Phf6Q9D4J7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Phf6Q9D4J7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Phf6Q9D4J7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms