Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkrip1Q9CWV6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms