Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pfdn1Q9CWM4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pfdn1Q9CWM4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pfdn1Q9CWM4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pfdn1Q9CWM4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pfdn1Q9CWM4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pfdn1Q9CWM4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pfdn1Q9CWM4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pfdn1Q9CWM4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pfdn1Q9CWM4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
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Pfdn1Q9CWM4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfdn1Q9CWM4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pfdn1Q9CWM4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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