Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rdh10Q8VCH7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms