Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcho1Q8K285 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fcho1Q8K285 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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