Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbm28Q8CGC6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm28Q8CGC6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms