Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FarsaQ8C0C7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms