Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms