Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arhgef17Q80U35 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Arhgef17Q80U35 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Arhgef17Q80U35 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Arhgef17Q80U35 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Arhgef17Q80U35 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Arhgef17Q80U35 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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