Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
NischQ80TM9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
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