Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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