Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TwistnbQ78WZ7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms