Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssx9Q6XAS3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssx9Q6XAS3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssx9Q6XAS3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssx9Q6XAS3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssx9Q6XAS3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssx9Q6XAS3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssx9Q6XAS3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms