Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Pdzrn3Q69ZS0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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