Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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