Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Klf3Q60980 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms