Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psme4Q5SSW2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psme4Q5SSW2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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