Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms