Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Syne3Q4FZC9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syne3Q4FZC9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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