Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms