Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
YrdcQ3U5F4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms