Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms